会員区分
本協会の会員は、次の３区分とします。
また、正会員をもって一般社団法人及び一般財団法人に関する法律上の社員とします。（定款第６条より）
①正会員
本協会の目的に賛同して入会した水族館等の団体
②賛助会員
本協会の事業を賛助するために入会した団体及び個人
③個人会員
本協会の目的に賛同して入会した個人
正会員
| 所在地（都道府県） | 施設名称 |
|---|---|
| 北海道 | 登別マリンパークニクス |
| 青森 | 青森県営浅虫水族館 |
| 山形 | 鶴岡市立加茂水族館 |
| 宮城 | 仙台うみの杜水族館 |
| 茨城 | アクアワールド茨城県大洗水族館 |
| 千葉 | 鴨川シーワールド |
| 東京 | 足立区生物園 |
| 東京 | マクセル アクアパーク品川 |
| 東京 | しながわ水族館 |
| 神奈川 | カワスイ 川崎水族館 |
| 神奈川 | よみうりランドアシカ館 |
| 神奈川 | 横浜・八景島シーパラダイス |
| 神奈川 | 新江ノ島水族館 |
| 神奈川 | 相模川ふれあい科学館 「アクアリウムさがみはら」 |
| 山梨 | 山梨県立富士湧水の里水族館 |
| 新潟 | 新潟市水族館 マリンピア日本海 |
| 新潟 | 上越市立水族博物館 「うみがたり」 |
| 富山 | 魚津水族館 |
| 石川 | のとじま臨海公園水族館 |
| 福井 | 越前松島水族館 |
| 静岡 | 幼魚水族館 |
| 静岡 | あわしまマリンパーク |
| 静岡 | 伊豆・三津シーパラダイス |
| 静岡 | 下田海中水族館 |
| 愛知 | 名古屋港水族館 |
| 愛知 | 南知多ビーチランド |
| 岐阜 | 世界淡水魚園水族館 「アクア・トトぎふ」 |
| 三重 | 鳥羽水族館 |
| 三重 | ゼロ距離水族館 伊勢シーパラダイス |
| 大阪 | ノアドルフィンドーム |
| 兵庫 | 神戸須磨シーワールド |
| 兵庫 | AQUARIUM×ART átoa |
| 兵庫 | 淡路じゃのひれドルフィンファーム |
| 和歌山 | 太地町立くじらの博物館 |
| 和歌山 | ドルフィンリゾート |
| 島根 | 島根県立しまね海洋館 「アクアス」 |
| 広島 | 宮島水族館 |
| 山口 | 下関市立しものせき水族館 「海響館」 |
| 香川 | 日本ドルフィンセンター |
| 香川 | 四国水族館 |
| 愛媛 | ドルフィンファームしまなみ |
| 高知 | 桂浜水族館 |
| 高知 | 室戸ドルフィンセンター |
| 高知 | むろと廃校水族館 |
| 高知 | 高知県立足摺海洋館 SATOUMI |
| 長崎 | 西海国立公園九十九島水族館 「海きらら」 |
| 長崎 | 長崎ペンギン水族館 |
| 大分 | 大分マリーンパレス水族館 「うみたまご」 |
| 大分 | うみたま体験パーク つくみイルカ島 |
| 熊本 | 海中水族館 シードーナツ |
| 宮崎 | 志布志湾海の駅イルカランド |
| 沖縄 | オキナワマリンリサーチセンター |
| 沖縄 | DMMかりゆし水族館 |